Dans le Parc naturel des Aiguamolls de l’Empordà, il y a la mer, des plages et bancs de sable côtiers, des marais salants ou marécages salés, des lagunes côtières, des étangs et des marais d’eau douce. Par ailleurs, le Parc naturel a favorisé la récupération et la création de nouveaux lacs et étangs, comme ceux du El Cortalet ou Europa, de rivières, de canaux et canaux d’irrigation, dont la végétation présente un grand intérêt botanique et faunistique. Le Parc naturel regorge aussi de cultures, comme celle du riz, récupérée depuis la création du parc, de clôtures et de prises, de maquis et de terrains non irrigués, comme la zone des Els Aspres, recouverte de cultures sèches (comme les vignobles), de maquis et de pâturages, de forêts de liège, de chênes verts et de chênes, ainsi que de parcelles de pins à certains endroits. On y trouve également un bon nombre de fermes, de basses-cours et de hameaux dispersés dans la plaine, qui sont souvent intégrés dans le paysage et servent de refuge à la faune et à la flore sauvages.

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  5.000ha

  (de les quals un 20% sota la figura de Reserva Natural Integral estrictament protegida. Dividida en tres grans espais: al Nord la Reserva Integral dels Estanys, al Sud la de les Llaunes i la de l’Illa de Caramany a Sant Pere Pescador.)